Imo jest to efekty wizualny, chociaż nie mam pojęcia w jakim celu to zrobili poza tym w Endzie, kiedy mamy Eve 01 w kosmosie to lepiej je widać, niż krótkie i ma to na celu pokazanie, że Eva żyje i jest w niej dusza.
Co do motywów Yui myśle, ze ona chciała to zrobić jak stwierdził Dred, ale później kiedy Shinji podrośnie i będzie mu się łatwiej/częściowo pogodzić z pewnymi rzeczami, jednak coś nie poszło na testach i jest jak jest. Czemu nie wróciła? IMO skoro plan i tak zakładał to nie było sensu, jeśli jej śmierć została ogłoszona w krótkim czasie po wypadku, a nie po próbie wyciągnięcia to były by problemy; no i jeszcze Shinji. Dzieciak myśli, że mamusia nie żyje, a ona wraca, więc się cieszy, problem w tym, że jeśli plan nie uległby zmianie to Yui dalej by go realizowała, a Shinji nie zniósłby drugi raz "utraty" matki, więc zapewne stwierdziła, że tak będzie lepiej i że Gendo będzie starał sie ją mu zastąpić. Oczywiście nie przewidziała, ze Gendo zmieni sie w takiego drania.
