Makoto i Aoba gadają o N2, po chwili leci na nich ów pocisk. N2 zrzucili kilka razy, ale efekt nie był taki, jak w przypadku Enda. Po chwili w biurze premiera ktoś mówi
Odnotowalismy eksplozję nuklearną 3 minuty temu.
Chcą też zapieczętować wszystko na 20 lat, jak Stare Tokio. Pierwsze Tokio zostało zniszczone właśnie bombą atomową.
Zauważcie, że End ma inny stopień cenzury, niż seria. W serii nie uświadczymy wyraźnych scen zabijania ludzi, widoku nagich piersi (bez zaciemnienia sutków) itp. end jest "mocniejszy" od serii.
Japończycy jako jedyna nacja doświadczyli ataku nuklearnego i lęk przed bombą atomową jest u nich naprawdę wyraźny (nawet w takiej Love Hina widać tego ślady), dlatego w serii nie używają nigdy bomby atomowej. W Endzie pokazanie jej już było możliwe.
W Endzie jest też mowa o skażeniu terenu, poza tym oni nie chcą wcale przejęcia NERVu, chcą tylko zabrać Evy (bo chce ich SEELE) i zalać wszystko betonem, albo czymś podobnym