Na zachowania Rei Gendo reaguje o wiele bardziej emocjonalnie, niż w przypadku unitu 01, który jest mu potrzebny w równym stopniu (a nawet bardziej, bo jak coś, to kolejnego unitu z akwarium nie wyjmie). Rei miała być substytutem Yui, tyle, że Gendo (a tak po prawdzie to Fuyutsuki, na polecenie Gendo) stworzył ją dopiero w sześć lat po śmierci żony. Zastępczym obiektem uczuć była wtedy dla nie go Naoko, wiec jeśli mówimy o Rei jako o zastępstwie Yui, to jest to jakieś zastępstwo wyższego rzędu.